På same måte som Plattformstøtte, fungerer òg Applikasjonsstøtte som ei brukarstøtte i andre linje.

Hovudkompetansen er innan dei store kliniske og administrative systema. Ein vesentleg del av arbeidet dreiar seg om DIPS.

Seksjonen bidrar òg i pågåande prosjekt. Fleira av dei tilsette i Applikasjonsstøtte har bakgrunn frå sjukehus.